A FIEK célja olyan ipari-felsőoktatási együttműködési szervezeti forma kialakítása, amely alkalmas: 
az ipari partnerek igényeinek megfelelő K+F+I kapacitás létrehozására versenyképes termékek és szolgáltatások fejlesztésére termékek versenyképes gyártásának fejlesztésére melynek eredményeként az érintett termékek piacképesek maradnak vagy piacképesekké válnak a partnercégeknél. A FIEK Kompetencia Központok feladata olyan nagyvállalatok által indukált problémák tudományos igényű megválaszolása, amelyek a régió kis- és középvállalkozásainál kézzelfogható termékfejlesztésként hasznosulnak.